O INA tem vindo a celebrar diferentes protocolos de colaboração com o objetivo de institucionalizar a cooperação nos domínios da consultoria, da formação e da capacitação dos agentes da Administração Pública portuguesa.
Atualmente o INA tem em vigor os seguintes protocolos:
- Agência para a Energia (ADENE)
- Alto Comissariado para as Migrações (ACM, I.P.)
- Autoridade de Segurança Alimentar e Económica (ASAE)
- Autoridade Nacional de Comunicação (ANACOM)
- Autoridade para as Condições do Trabalho (ACT)
- Biblioteca Nacional de Portugal (BNP)
- Centro de Estudos Judiciários (CEJ)
- Comissão de Coordenação e Desenvolvimento do Algarve (CCDRAlg)
- Comissão Nacional de Proteção de Dados (CNPD)
- Comissão para a Cidadania e Igualdade de Género (CIG)
- Direção-Geral da Administração Escolar (DGAE)
- Direção Regional de Economia do Nort (DREN)
- Escola Nacional de Saúde Pública (ENSP)
- Imprensa Nacional – Casa da Moeda, S.A. (INCM)
- Inspeção-Geral da Agricultura, do Mar, do Ambiente e do Ordenamento do Território (IGAMAOT)
- Inspeção-Geral de Finanças (IGF)
- Instituto da Defesa Nacional (IDN)
- Instituto de Estudos Superiores Militares (IESM)
- Instituto de Gestão Financeira e Equipamento da Justiça (IGFEJ)
- Instituto de Higiene e Medicina Tropical (IHMT)
- Instituto dos Mercados Públicos do Imobiliário e da Construção (IMPIC)
- Marinha Portuguesa
- Centro de Competências de Planeamento, de Políticas e de Prospetiva da Administração Pública (PlanAPP)
- Secretaria-Geral da Presidência da República
